Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
D130040H23RikQ8BII3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
D130040H23RikQ8BII3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D130040H23RikQ8BII3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms