Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Susd4Q8BH32 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Susd4Q8BH32 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Susd4Q8BH32 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Susd4Q8BH32 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Susd4Q8BH32 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Susd4Q8BH32 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Susd4Q8BH32 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms