Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8BGC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8BGC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms