Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efr3aQ8BG67 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Efr3aQ8BG67 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efr3aQ8BG67 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efr3aQ8BG67 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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