Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Necab1Q8BG18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Necab1Q8BG18 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms