Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg4cQ811C2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms