Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcsk9Q80W65 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk9Q80W65 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk9Q80W65 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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