Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Avl9Q80U56 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Avl9Q80U56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms