Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NischQ80TM9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NischQ80TM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
NischQ80TM9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
NischQ80TM9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NischQ80TM9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
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