Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lca5Q80ST9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lca5Q80ST9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms