Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lamp3Q7TST5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms