Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf516Q7TSH3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf516Q7TSH3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf516Q7TSH3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms