Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms