Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf18Q7TS55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf18Q7TS55 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms