Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox11Q7M6Y2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox11Q7M6Y2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox11Q7M6Y2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms