Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sys1Q78S06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sys1Q78S06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms