Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SynmQ70IV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SynmQ70IV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SynmQ70IV5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SynmQ70IV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SynmQ70IV5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SynmQ70IV5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SynmQ70IV5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SynmQ70IV5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SynmQ70IV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms