Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpv1Q704Y3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpv1Q704Y3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpv1Q704Y3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms