Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Topbp1Q6ZQF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Topbp1Q6ZQF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms