Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp34Q6ZQ93 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp34Q6ZQ93 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms