Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ino80Q6ZPV2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ino80Q6ZPV2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ino80Q6ZPV2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms