Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LcorQ6ZPI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LcorQ6ZPI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.2 ms