Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M2Q6W9L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms