Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr12Q6QNU9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr12Q6QNU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr12Q6QNU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms