Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NfrkbQ6PIJ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfrkbQ6PIJ4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms