Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip4Q6PHZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnip4Q6PHZ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms