Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d2Q6PHS9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms