Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC9

Zfp341, Zinc finger protein 341, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp341Q6PGC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp341Q6PGC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp341Q6PGC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp341Q6PGC9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms