Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup98Q6PFD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup98Q6PFD9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup98Q6PFD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms