Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Taf1cQ6PDZ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf1cQ6PDZ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms