Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85bQ6PDY0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms