Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SvoplQ6PDF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SvoplQ6PDF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms