Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa4Q6P8K8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpa4Q6P8K8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpa4Q6P8K8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms