Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NesQ6P5H2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NesQ6P5H2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NesQ6P5H2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms