Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slx4Q6P1D7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Slx4Q6P1D7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slx4Q6P1D7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slx4Q6P1D7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms