Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpbp1l1Q6NZP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms