Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pprc1Q6NZN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pprc1Q6NZN1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Pprc1Q6NZN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pprc1Q6NZN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms