Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
2810408A11RikQ6NSU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
2810408A11RikQ6NSU2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
2810408A11RikQ6NSU2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms