Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fbxo41Q6NS60 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fbxo41Q6NS60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fbxo41Q6NS60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fbxo41Q6NS60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fbxo41Q6NS60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms