Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mvb12bQ6KAU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mvb12bQ6KAU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mvb12bQ6KAU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms