Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep78Q6IRU7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep78Q6IRU7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms