Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Carmil1Q6EDY6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Carmil1Q6EDY6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Carmil1Q6EDY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Carmil1Q6EDY6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms