Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nop58Q6DFW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nop58Q6DFW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms