Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q6DFW0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q6DFW0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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