Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Cep170Q6A065 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cep170Q6A065 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cep170Q6A065 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cep170Q6A065 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms