Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Swap70Q6A028 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Swap70Q6A028 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Swap70Q6A028 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms