Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pdzrn3Q69ZS0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdzrn3Q69ZS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms