Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc2Q69ZB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc2Q69ZB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc2Q69ZB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms