Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrcc1Q69ZB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms