Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a3Q64518 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp2a3Q64518 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2a3Q64518 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms